Né le 22 septembre 1928 à Boleke, dans l’actuelle province de l’Équateur, Justin‑Marie Bomboko devient en 1959 le premier Congolais diplômé de l’Université libre de Bruxelles en sciences politiques et administratives. À l’indépendance du Congo en juin 1960, Patrice Lumumba le nomme Commissaire général aux Affaires étrangères et au Commerce extérieur, poste stratégique qu’il occupe de 1960 à 1963.
Le jour même de l’indépendance, le 30 juin 1960, Bomboko co-signe avec Lumumba et les autorités belges l’acte fondateur de la souveraineté congolaise. Le 5 juillet, lorsque la Force publique se mutine, il assume la sécurité des délégations étrangères, empêchant ainsi un recours aux troupes belges et engageant la diplomatie congolaise pour résoudre la crise.
Après le coup d’État de Mobutu en septembre 1960, il devient Président du Collège des Commissaires généraux, assurant le gouvernement provisoire jusqu’en février 1961. De 1965 à 1969, il rerçoit le portefeuille des Affaires étrangères sous le régime zaïrois, avant de devenir ambassadeur à Washington puis en Belgique dans les années 1980.
Il décède à Bruxelles le 10 avril 2014 à l’âge de 86 ans.